Так всегда было. Изучите вопрос доскональнее. Мы не были в курсе лет 25, потому что слишком много политиков руководствовалось парадигмой «если чего-то нет, мы это лучше купим, чем создадим». Тем не менее все институты работали по разным заказам, просто в гораздо меньших обьемах, чем в СССР до где-то 2004-5 годов точно, дальше уже пошли большие заказы от государства. Все, что наше вы заметите сейчас из продвинутого на полки, не было придумано недавно и на коленке, оно просто не прекращало разрабатываться, другое дело — зависимость финансирования влияла на интенсивность скорости разработки. За последние 10 лет на этапе обновления взаимодействия частного и гос. партнерства создали технопарки при вузах главных в стране + главное связующее венчурное и инновационное звено с западом Сколково.

Почему бы крупным предприятиям ОПК, электроники, машиностроения, автомобиле и самолетостроения, да чего угодно ,не наладить тесные контакты с институтами?

Идея сама по себе хорошая, но тут есть одна проблема. Предприятия живут по плану и завися от заказов, а институты и университеты гарантировать сроки не могут (это своих инженеров и конструкторов можно пинать как хочешь, а студенты только учатся, причём в совсем другой конторе). Поэтому по серьёзному включить в работы не получается. Вот если сроки достаточно большие то для решения мелких задач институты\университеты привлекать очень даже нужно.

В вузах обычно полный бардак, так что открывать в них что-либо, а потом сопровождать — очень проблематично. Администраторы зачастую ведут себя в стиле дикого барина. Раньше за ними присматривала партия, а сейчас механизмов фактически нет.

И МФТИ тут совсем не исключение. Скорее один из самых ярких представителей. Там ведь скандал на скандале, и чем дальше, тем всё диковинней. Много что прорывается в сеть — можете почитать, поискать.

И да, еще вот что. Конечно, американские вузы сейчас гораздо сильнее наших даже в точных науках. При СССР было сопоставимо, но то время кануло в лету.