Но здесь же речь идет о самостоятельной единице комплекта С-500.

Она настолько же самостоятельная, насколько самостоятельна любая боевая единица в современном типе сетецентрической войны. Все современные виды вооружения максимально взаимоувязываются между собой как по обмену информацией, так и по наиболее эффективному распределению целей. Нет особого смысла лупить из С-500 по самолету, находящемуся в 100 км, если можно ударить по нему из С-350. С-500 все-таки создан в первую очередь для задач контроля ближнего космоса, где баллистические ракеты до момента разделения боеголовок наиболее уязвимы (не считая момента старта и набора высоты), а также расширения радиуса обороны. Ну, а кроме того, вопрос безопасности никто не отменял и Панцирь-С1 для С-400/500 это больше не рубеж обороны объекта, который прикрывает этот самый С-400/500, а рубеж обороны самого комплекса С-400/500.

Вот интересно было бы узнать о радаре для крылатых ракет у С-500 и сравнить с характеристиками радара Панциря). Тогда б было понятно.

Несравнимые вещи, созданные для разных задач. Даже для самого С-500 радаров будет несколько, в зависимости от типа обнаруживаемых целей. Кроме того, задача у этих радаров быть глазами/ушами целого набора комплексов по обороне рубежа/объекта, как для ЗРК более низкого класса, так и, например, для самолетов с выключенным АФАР-радаром в условиях отсутствия самолетов ДРЛО. У Панциря же цель одна, а значит радар узкоспециализированный.