И всё же:
- почему борт RA-89005

думаю лучше эти вопросы адресовать либо непосредственно в Аэрофлот, либо тому, кто так написал на викидоте (т.е. информацию ещё нужно перепроверять).

- что означает "В процессе передачи (ЛИК в Жуковском: доработки+СБ)"

потому что так распределили работу - часть проверок и доработок в Комсомольске-на-Амуре во время ЛИС (решают технические проблемы), часть - в Жуковском (уже после перегона из Ульяновска, где устанавливают салон). То есть, возможно, в Жуковском решают любые потенциальные проблемы качества сборки салона, т.к. требования у заказчиков очень жесткие, чтобы качество сборки и подогнанность всех панелей были не хуже чем в аэробусах и боингах.

Так что всё это делается для повышения качества и для ускорения темпа производства.