Здание вокзала в Зеленогорске было построено в 1917 году. Во время Советско-Финской и Великой Отечественной войны оно сильно пострадало, и только в 1947 году вокзал был восстановлен по проекту архитектора А.А. Гречанникова и с тех пор не перестраивался. В 2009 году руководством Октябрьской магистрали было принято решение о проведении полной реконструкции Зеленогорского вокзала.

К лету 2012 года все ремонтные работы были завершены. Поменялся как внешний облик здания, так и все внутренние коммуникации: была осуществлена перепланировка помещений, установлены турникеты, обновлен тоннель под путями, появилась современная система видеонаблюдения и оповещения. Инвестиции в проект составили более 251 млн рублей.