стань автором. присоединяйся к сообществу!
  • Сергей Шмаков, аспирант лаборатории профессора Константина Северинова Сколковского института науки и технологий (Сколтех), получит премию директора Национальных Институтов Здоровья США за исследования в области новых CRISPR-Cas систем для редактирования генома.

    Премию директора Национальных Институтов Здоровья США каждый год получают ученые и клиницисты, которые добились хороших результатов: открыли новые биологические механизмы и процессы, изобрели новые биомедицинские устройства, сообщает пресс-служба Сколтеха.

    Россиянин Сергей Шмаков участвовал в открытии новой Crisp-Cas системы C2c2 для редактирования молекул РНК, которая может стать основной для создания нового инструмента контроля работы генов в живых клетках. Открытая система позволяет ученым изменять по своему желанию определенные участки генома.

    0 читать дальше

  • Группа российских ученых создала программу, благодаря которой можно сравнивать между собой ДНК микроорганизмов, обитающих в разных средах, и выявлять прежде неизвестные науке виды бактерий и вирусов.

    В исследованиях принимали участие ученые из Университета ИТМО, Федерального научно-клинического центра (ФНКЦ) физико-химической медицины и МФТИ. Rosnauka.ru кратко уже рассказывала о разработке, теперь же нашему изданию удалось узнать подробности о проведенных исследованиях.

    Программа, созданная учеными, позволяет шагнуть далеко вперед в развитии персонализированной медицины, то есть основанной на индивидуальных особенностях каждого конкретного пациента. У каждого человека есть, как известно, свой геном — особая последовательность генов, которая и задает развитие организма. Но существует и еще одна полседовательность генов, метагеном, представляющая собой совокупность ДНК микроорганизмов, обитающих в одной среде: бактерий, грибов, вирусов. Именно по метагеному можно вывить наличие у человека того или иного заболевания или предрасположенности к нему. Вот почему изучение микробиоты (микробов, обитающих в разных средах организма) занимает столь важное место в метагеномных исследованиях.

    0 читать дальше

    В марте лаборатория молекулярной диагностики Группы компаний Алкор Био завершила разработку линейки наборов для определения мутаций в гене CYP21A2. Мутации в гене CYP21A2, кодирующем фермент 21-гидроксилаза, являются причиной развития одного из наиболее распространенных наследственных заболеваний: врожденной дисфункции коры надпочечников (ВДКН). Более 90% случаев этого заболевания связано с нарушениями функционирования данного фермента.

    Заказчиком наборов для выявления мутаций в гене CYP21A2 выступила самарская компания «Ген-технология», апробация разработанных в ГК Алкор Био тест-систем проходила на базе ГБУЗ «Самарский областной центр планирования семьи и репродукции». После успешного завершения клинических испытаний, компания «Ген-технология» приступила к использованию новых наборов в диагностических целях.

    0 читать дальше

    Пример выделения всех k-меров длины для k=7 из произвольной последовательности

    © Изображение представлено пресс-службой МФТИ

    МОСКВА, 2 марта. /ТАСС/. Ученые из НИИ Физико-химической медицины ФМБА РФ, МФТИ и университета ИТМО предложили новый метод сравнения метагеномов — совокупности последовательностей ДНК всех организмов в исследуемом биологическом материале. Он позволяет сравнивать образцы быстрее и эффективнее, чем существующие аналоги, сообщает пресс-служба МФТИ.

    «Разработанная методика позволит более точно находить отличия между метагеномами разнообразных бактериальных сообществ, что, в частности, может помочь в изучении, диагностике и лечении многих заболеваний человека», — говорится в пресс-релизе.

    1 читать дальше

  • Группа ученых из Германии, Америки и России, при участии заведующего кафедрой Московского физико-технического института (МФТИ) Марка Бородовского, предложила алгоритм, который автоматизирует и делает более эффективным поиск генов. Разработка соединяет в себе преимущества наиболее продвинутых инструментов для работы с геномными данными. Предложенный метод позволит точнее и быстрее анализировать новые последовательности ДНК и находить полный набор генов в геноме.

    Статья, описывающая алгоритм, была недавно опубликована на страницах журнала Bioinformatics издаваемого Oxford Journals. При этом саму компьютерную программу уже скачали более 1500 различных центров и лабораторий по всему миру. Тестирование алгоритма показывает его существенно более высокую точность по сравнению с другими программами.

    4 читать дальше

  • Международная группа ученых под руководством экспертов СПбГУ провела уникальную работу по изучению генома африканского гепарда — хищника, находящегося под угрозой вымирания. Ученые обнаружили, что генетически все гепарды очень близки друг к другу. Это основная причина трудностей с размножением диких кошек и высокой чувствительности животных к самым простым вирусам.

    На фото: Гепард по кличке Chewbaaka (Намибия) вошел в число счастливцев, чей геном исследовали ученые СПбГУ

    В ходе работы ученые проанализировали 7 геномов гепарда: 4 генома гепарда из Намибии и 3 из Танзании. Проведя расшифровку геномов, а затем собрав их в целые последовательности (сборка полного генома гепарда была осуществлена впервые!), эксперты установили: по всему геному хищника наблюдается очень низкий уровень генетического разнообразия. По сравнению с другими кошками потеря генетического разнообразия у гепарда составляет 90-99%.

    4 читать дальше

    Источник фото: пресс-служба Казанского федерального университета

    В Казанском федеральном университете (КФУ) выделили ген микроорганизма, который отвечает за возможность усвоения труднодоступного для растений фосфора.

    По словам ученых, сейчас в почве наблюдается дефицит именно неорганического фосфора, который является одним из важнейших элементов питания всех живых организмов, участвует в метаболических процессах. По расчетам специалистов, запасов этого элемента хватит лишь на ближайшие 60 лет, сообщает пресс-служба Казанского федерального университета. Его недостаток в почве приводит к раннему листопаду, скудному цветению, к появлению мелких и, порой, слабоокрашенных плодов. Решение проблемы казанские ученые видят в том, чтобы обеспечить усвоение растениями труднодоступных запасов форсфора.

    5 читать дальше

    Федеральный исследовательский центр «Институт цитологии и генетики СО РАН» вывел новый сорт мискантуса — многолетней травы из семейства злаковых.

    Как сообщили в пресс-службе ФАНО России, это первая техническая культура, которая была создана в стране за последние 25 лет. Она отличается высоким уровнем содержания целлюлозы. При этом объем полезной биомассы в ней составляет 45%, что больше, чем в хлопке или дереве.

    По словам специалистов, технология добычи сырья из мискантуса довольно проста и не требует тяжелой химии. Путем микробиологической обработки из него можно будет получать широкий спектр продуктов с высокой добавленной стоимостью — биотопливо, порох и молочную кислоту — главный расходный материал для крупнотоннажной химии.

    Сейчас новосибирские генетики разрабатывают технологию массового производства мискантуса, который размножается не семенами, а корнями. Ученые уверены в успехе — они уже получили дополнительные ресурсы для реализации своего амбициозного проекта.

    Ранее по этой теме на СУН: sdelanounas.ru/blogs/45154/

    8 читать дальше

  • Институт цитологии и генетики СО РАН (ИЦИГ) объявил о регистрации первого федерального исследовательского центра (ФИЦ) в Сибири, которая состоялась 28 апреля 2015 года.

    Его глава — академик РАН Николай Колчанов рассказал, что к институту в виде филиала был присоединен Сибирский научно-исследовательский институт растениеводства и селекции СО РАСХН. Новая организация насчитывает более 1030 сотрудников, из них более 400 занимаются научными исследованиями. ФИЦ располагает крупными центрами коллективного пользования (среди них Центр генетических ресурсов лабораторных животных, Центр микроскопического анализа биологических объектов), общий объем земель сельхозназначения теперь превышает 30 тысяч га. Основная цель проекта — расширение применения прорывных генетических технологий для агропромышленного комплекса, медицины и биотехнологии.

    0 читать дальше

    Алексей Москалев

    Ученые из МФТИ и их коллеги из Института биологии КНЦ РАН в Сыктывкаре создали простой и надежный метод оценки генетических «поломок», связанных со старением — эти «часы» позволят, в частности, проводить долгосрочные исследования для оценки действенности препаратов, замедляющих старение. Результаты исследования были опубликованы в журнале Mutation Research.

    Старение организма всегда сопровождается накоплением повреждений в молекулах ДНК и снижением эффективности их самовосстановления. Эти два фактора ведут к общему ухудшению работы генетического аппарата и клеток в целом. Многочисленные исследования показали, что с возрастом растет количество повреждений ДНК, связанных с воздействием агрессивных соединений кислорода — свободных радикалов, в частности, разрывов нитей молекул.

    0 читать дальше

    В конце марта еще одна тест-система производства Группы компаний Алкор Био - «Гонадотропин ИФА — свободная бета-ХГч» для пренатального скрининга I триместра беременности — получила СЕ-марку. Теперь вся линейка наборов ГК Алкор Био для пренатального скрининга беременных в I и II триместрах имеет знак соответствия продукции европейскому стандарту качества — СЕ-марку, что позволяет осуществлять экспорт данных продуктов на рынок Евросоюза. Это наборы для определения маркеров беременности, указывающих на течение беременности и состояние плода: РАРР-А, свободная бета-ХГч, АФП и ХГч.

    0 читать дальше

    17 марта в Северо — Восточном федеральном университете им. М.К. Аммосова состоялось открытие Международного центра коллективного пользования «Молекулярная палеонтология» Института прикладной экологии Севера СВФУ.

    Центр коллективного пользования «Молекулярная палеонтология» станет первым и единственным местом в России, где на новейшем оборудовании с использованием уникальных технологий будут проводиться исследования по поиску живых клеток мамонта и изучению ДНК древних животных.

    8 читать дальше

    Ученые томского НИИ медицинской генетики разработали технологию, которая позволяет вычислить место рождения человека по образцу его ДНК, сообщила в понедельник пресс-служба инновационных организаций Томской области.

    «Если у нас есть образец ДНК, мы можем сказать, откуда этот человек, иногда с точностью до района. <…> Даже по небольшому количеству биологического материала — несколько волос, пятно крови — можно определить этнотерриториальное происхождение любого человека», — приводятся в сообщении слова замдиректора по научным вопросам НИИ медицинской генетики Вадима Степанова.

    4 читать дальше

  • Медико-генетический диагностический центр Санкт-Петербурга с февраля 2015 года в своей повседневной практике начнет проводить генетическое тестирование новорожденных на тяжелые наследственные заболевания, такие как муковисцидоз, фенилкетонурия и галактоземия, с применением технологии высокопроизводительного геномного анализа. Разработка и клинические испытания диагностического решения, которое будет использоваться в СПб МГЦ, были выполнены петербургской биотехнологической компанией Parseq Lab. На сегодняшний день это первый в России и один из первых в мире случаев, когда высокопроизводительное секвенирование генома начинает рутинно применяется в клинической практике, говорится в пресс-релизе компании.

    0 читать дальше

    В середине ноября Группа компаний Алкор Био — разработчик и производитель тест-систем для лабораторной диагностики — объявила о начале выпуска на рынок нескольких ключевых ферментов для исследований методом полимеразной цепной реакции (ПЦР). Это позволит ряду российских научно-исследовательских лабораторий отказаться от дорогостоящих импортных реагентов, что, в свою очередь, снизит себестоимость научных разработок.

    Речь идет о высокоочищенном рекомбинантном ферменте Taq полимераза, который идеально подходит для широкого круга рутинных аналитических исследований — амплификация ДНК, проведение ПЦР-скринингов, включение меченых нуклеотидов, ник-трансляция и т.д. А также о ферменте Taq М полимераза — высокоочищенном рекомбинантном ферменте с химической модификацией в активном центре, обеспечивающей высокоэффективный горячий старт. Преимущество Taq М полимеразы производства ГК Алкор Био перед большинством коммерческих аналогов заключается именно в наличии высокоэффективного горячего старта: при температуре в 25 градусов фермент полностью заблокирован (не имеет детектируемой активности).

    1 читать дальше

  • Сегодня ученые Центра геномной биоинформатики им. Ф. Г. Добржанского СПбГУ объявили о выпуске и публикации в журнале GigaScience интернет-платформы GWATCH, которая обещает повысить эффективность обнаружения и подтверждения геномных вариантов, отвечающих за устойчивость к хроническим заболеваниям человека. Доступ к геномному браузеру будет открытым — любой ученый сможет пользоваться его ресурсами.

    Геномный браузер GWATCH — это размещенная на сервере СПбГУ интернет-платформа для автоматического анализа данных с целью обнаружения генов, отвечающих за комплексные заболевания человека.

    4 читать дальше

    13 октября 2014 года в Санкт-Петербурге, при поддержке Комитета по социальной политике города, прошла конференция, посвященная генетическому тестированию для профилактики и лечения наследственных заболеваний. Организаторами конференции выступили Национальная Ассоциация организаций больных редкими заболеваниями «Генетика» и центр «Genetico» Института Стволовых Клеток Человека (ИСКЧ). Мероприятие посетили врачи, представители научно-исследовательских организаций, медико-генетических лабораторий, медицинских центров и женских консультаций, пациентских и медико-социальных организаций.

    Накануне Институт Стволовых Клеток Человека открыл в Санкт-Петербурге современный Медико-генетический центр Genetico, в котором жители города могут провести диагностику и получить консультацию генетика для поддержания собственного здоровья, здоровья детей, а также для предупреждения рождения в семье потомства с тяжелой наследственной патологией. Центр открыт в рамках социально-значимого проекта по созданию общероссийской сети медико-генетических центров, который ИСКЧ развивает при участии Биофонда РВК.

    0 читать дальше

    Первые в России

    В начале августа Группа компаний Алкор Био — разработчик и производитель тест-систем для лабораторной диагностики — объявила о завершении работ по созданию ДНК-карт для сбора, выделения и хранения образцов биоматериала. Лаборатория молекулярной диагностики ГК Алкор Био разработала несколько видов ДНК-карт, одна из них уже выпущена на рынок, остальные отправлены в Росздравнадзор РФ на регистрацию. Сегодня в мире существует всего несколько аналогичных продуктов, на территории России зарегистрирована только одна подобная карта европейского производства, отечественных картдля сбора и хранения ДНК до настоящего времени не существовало.

    2 читать дальше

    9 апреля 2014 года в Сочи на III Международной конференции «Генетика старения и долголетия» специалисты Института стволовых клеток человека (ИСКЧ) рассказали о разработанной ИСКЧ совместно с Институтом цитологии РАН (Санкт-Петербург) и Национальным институтом здоровья (Бетезда, США) искусственной хромосоме человека для коррекции наследственных поясно-конечностных мышечных дистрофий и гемофилии, передает корреспондент «Газеты.Ru» из Сочи.

    Искусственная хромосома человека (Human artificial chromosome, HAC) представляет собой созданную методами хромосомной инженерии «микрохромосому», содержащую необходимые разработчикам гены. Главное достоинство HAC – стабильная долгосрочная экспрессия без влияния на геном клетки-хозяина. Искусственная хромосома не встраивается и не нарушает ДНК пациента, эффективно работает длительное время, может доставить в клетку гораздо больше генетической информации, чем любые другие векторы, а кроме того, при делении клетки такая хромосома равномерно передастся дочерним клеткам.

    0 читать дальше

    В Алтайском крае российские ученые разработали специальный прибор, который позволит быстро и эффективно проверять продукты на ГМО. В будущем его начнут продавать массово.

    Поскольку прибор портативен и весит всего килограмм, им можно будет пользоваться у себя дома. Всего за 50 минут наличие модифицированных организмов в продуктах сможет самостоятельно проверить каждый россиянин. О новинке рассказал Максим Куцев, заведующий лабораторией биоинженерии, где создавался данный аппарат. В ближайшее время ученые планируют сократить время, которое аппарат тратит на проверку, до 20 минут.

    Ранее проверить продукты на наличие в них ГМО можно было только в специально оборудованных лабораториях. Срок массового выпуска прибора в продажу и его стоимость пока не раскрывается.

    19 читать дальше